Dans une lettre envoyée le 11 octobre 2007 au Secrétaire général de l’ONU Ban Ki-Moon et au Secrétaire général de la Ligue arabe Amr Moussa, le Premier ministre libanais Fouad Al-Siniora a accusé la Syrie d’être derrière le Fath Al-Islam. Al-Siniora a affirmé que, selon des informations obtenues par les détenus du Fath Al-Islam, les dirigeants de l’organisation s’étaient trouvés en contact direct avec des responsables des renseignements syriens. Il a ajouté que la plupart des combattants de l’organisation avaient infiltré le Liban de façon illégale par la frontière syrienne et que les services de renseignements syriens s’étaient servis de l’organisation pour poursuivre leurs objectifs politiques et sécuritaires au Liban
Dans la 2ème partie de la lettre, Al-Siniora s’est dit préoccupé par le fait que de nombreuses factions politiques au Liban s’arment, précisant que la Syrie avant transféré une quantité importante d’armes à ses supporters au Liban, pendant et après la guerre de juillet 2006.
En réaction à la lettre de Siniora, la Syrie a envoyé sa propre lettre à Ban Ki-Moon, dans laquelle les accusations de Siniora sont qualifiées de « mensonges » qui « méritent à peine qu’on y réponde ». Selon la lettre syrienne, preuve a été faite que des éléments internes au gouvernement libanais ont apporté une aide matérielle et un soutien moral au Fath Al-Islam
Lire des extraits de la lettre traduits en anglais: http://www2.memri.org/bin/articles.cgi?Page=archives&Area=sd&ID=SP174707.